La Comisión Nacional de los Derechos Humanos (CNDH) criticó que al menos cuatro dependencias federales fueron omisas en la protección del Alto Golfo de Baja California, lo cual provocó que la vaquita marina se encuentre en proceso de extinción y se permitió la pesca furtiva de la totoaba.
A través de su Recomendación 93/2019, el organismo autónomo dijo que la Semarnat, la Sader, la Profepa y la Conapesca no llevaron a cabo "acciones necesarias y efectivas para la protección y conservación de dichas especies (la vaquita marina y la totoaba), además de que omitieron su obligación de emplear hasta el máximo sus recursos para proteger dicha Reserva de la Biosfera".